本會採委員制，由縣長兼任召集人，並聘請縣政府相關單位主管，及金融、工商界與民意代表等為委員，委員會下設總幹事一人及若干名會務人員，負責執行會務與工作任務。

組織架構說明：策進會（委員會→縣長兼召集人→總幹事→專員→幹事）→經濟部投資業務處、經濟部工業局、經濟部中小企業處。